En Pájara encontramos diversas localidades que se disponen en distintos puntos del municipio, nunca por encima de los 250 metros de altitud. De esta manera, La Pared, Montañas Blancas, Lajita, Ajuy, Cardón, Totó y la capital, Pájara, esta de mayor volumen poblacional, se encuentran al norte del istmo de la pared, lindando con los municipios de Betancuria y Tuineje, mientras que el resto de los núcleos de población se hallan sobre todo en la península de Jandía, con la excepción de Costa Calma y Los Verdes, que se encuentran en un flanco oriental del istmo.

El resto de  las poblaciones que forman parte de Pájara son Cofete, Mézquez, Marabú, Morro Jable y Puertito de la Cruz,todas las cuales se encuentran en la península de Jandía. Se tratan en su mayor parte, de núcleos cercanos a la costa, con  personalidad turística, en donde la presencia de infraestructuras hoteleras está presente, aunque sin llegar a un uso abusivo del suelo que ponga en serio peligro el patrimonio natural de la mayor parte del área.

Algunos núcleos de población de Pájara